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表皮生长因子受体基因突变检测(EGFR)

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概述

参考范围

(1)参考区间:野生型。

(2)可报告区间为:野生型/突变型。

临床意义

通过检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变与否,可以筛选出药物靶向治疗的最适人群。非小细胞肺癌(NSCLC)中腺癌EGFR基因突变的发生率在西方国家为10%,亚洲人群达到50%,在不吸烟者、女性以及非粘液性肿瘤中发生率更高。EGFR基因突变主要发生于18-21外显子上的29种突变。药物敏感性突变:19del、L858R、G719X、S768I、L861Q,以19-Dle、L858R最为常见,约占所有突变的85-90%,检测到此种类型的突变为敏感性突变,说明患者对酪氨酸激酶抑制剂(TKI)等靶向药物治疗有效的可能性大;药物耐药性突变:20外显子T790M、20ins。当突变类型为T790M时,多为继发突变,为耐药突变,表明患者可能对靶向药物治疗效果不佳。

 研究显示酪氨酸激酶抑制剂(TKI)对药物敏感性突变的受益率达70%以上。

 NSCLC患者治疗前应尽量获取标本,进行EGFR基因突变检测;对于没有EGFR基因突变的患者,可再检测ALK和ROS-1融合基因;或者进行EGFR基因突变、ALK和ROS-1融合基因同时联合检测。

影响因素

 严格按照临床核酸扩增实验室的要求进行实验室管理。由于PCR方法敏感,要避免扩增前标本之间的交叉污染,也要避免扩增后产物的污染;同时要防止标本选择不当、采样错误、核酸的降解、丢失,扩增抑制物存在等因素对实验的影响。

1) 标本采集:可使用经病理确诊后的癌组织的石蜡切片,同时送检HE染色切片。取样组织中应确定含有30%以上的肿瘤病变细胞,所取部分尽量在蜡块中部。胸腹水,为防止凝固可使用EDTA抗凝管,采集后混匀,避免污染;也可留取新鲜组织,等病理结果确认后再检测。标本要避免溶血、严重脂血及交叉污染。

2) 标本保存及运输:采集后立即送检(<2h),如不能立即送检2~8℃存放<48 h。避免污染及核酸降解。

3) 注意事项:如应用ARMs方法仅能检测出试剂盒列出的EGFR已知突变,无法检测未知突变。一次核酸扩增结果为野生型,并不能完全排除突变,标本可能存在其他未知突变,也可能由于样品核酸质量、肿瘤异质性等原因造成;不合理的样本采集、转运及处理、样本中肿瘤细胞DNA量过低或者片段化严重均可导致假阴性结果;检测的靶序列区域出现变异或者其他原因导致的序列改变可能会导致假阴性结果;未经验证的其他干扰因素或者扩增抑制因素也可能导致假阴性结果。同时要注意防止污染造成的假阳性结果。

4)干扰因素:有可能抑制核酸扩增的物质,如肝素,严重溶血、酸性福尔马林等。

方法学

实时荧光PCR(AMRs),一代测序,二代测序等。

该项目可用检验装备