随着测序成本的下降,二代测序技术已经越来越普遍地应用到临床诊断中,是否能够掌握数据分析技术已经成为提高遗传病诊断率的一个瓶颈。
很多公众号朋友反馈:看了那么多的关于二代测序分析的书籍与视频教程,可是自己实际操作起来还是碰到许多小问题,不能按照教程继续下去,要是有老师在身边就好了;
很多搞临床检验的朋友说:我对一代测序比较熟,对二代测序理论比较了解,但是二代测序究竟用哪些软件和数据库还不熟悉;
很多遗传分析师说:你给我注释好的excel表格,我可以继续分析出报告,但是对生信不了解,虽然平时也想学,但是身边的生信同事实在是太忙了,他也不可能从头到尾给我讲一遍。
很多在校学生认为:二代测序数据分析的职业前景不错,但是没有实际的案例和数据,无从下手学习。
很多临床医生抱怨:二代数据分析就像一个黑盒子,我想知道这中间到底是一个什么样的分析过程,有哪些因素会影响分析结果。
为了解决以上痛点,基因游侠开展临床遗传病二代测序生信分析实操培训班,理论与操作相结合,小班教学,结合自己8年自学生信分析经验,降低临床生信的入门门槛,开设专门的微信讨论学习群,帮助大家快速掌握临床生物信息分析的步骤与方法,更好地将二代测序应用于实际工作。为了进一步提高大家解决遗传病临床和科研的实际工作能力,基因游侠邀请基因侦探王剑老师给大家讲讲遗传新基因的发现和NGS质量控制,王剑老师在临床基因诊断方面具有丰富的经验,相信经过两天的学习,学员们一定会对二代测序数据分析有不一样的理解与感受。
以下为第二十二期招生信息
时间:4月13-14日(周六周日两天),9:00-18:00
地点:上海市浦东新区东方路仁济医院附近
费用:3000元(赠送1T移动硬盘一块)
学员要求:分子生物学、检验学、医学相关专业毕业
电脑硬件:自带笔记本(性能越高越好),内存至少8G,支持虚拟机安装
操作系统:window 64位操作系统,苹果系统不支持
人数:30人,招满即止
目的:拿到原始数据后,不依赖其他收费软件自己可以进行独立的生信分析。
特色:贴近临床实际情况,解决工作中的问题
内容:
基因侦探王剑
1.NGS实验基本流程
2.新致病基因的鉴定
3.NGS数据质量控制
4.致病基因(变异)的筛选与评估
5.变异精准解读影响因素
6.NGS分析CNV
7.案例分析
基因游侠
1、CentOS系统的介绍
2、实际操作fastQC查看数据质量
3、speedseq比对原始数据
4、如何分析覆盖度与测序深度
5、GATK call突变及位点过滤
6、annovar注释及筛选
7、IGV查看reads比对情况
8、怎么分析trio新发突变
9、怎么使用Exomiser分析复合杂合变异
10、怎么筛选大家系多个样本候选位点
11、以DMD为例,利用NGS分析外显子缺失与重复
12、XYAutoFilter软件的使用
13、利用WES分析SMN1拷贝数
主办:基因检测与解读微信公众号
协办:上海寻因生物科技有限公司
常见问题:
Q: 培训费用可以开发票吗?
A:可以的
Q:感觉自己基础比较差,担心学不会怎么办?
A:首先我们将复杂的代码都进行了预先编写,不需要学员编码复杂的代码;其次我们选择了界面化的centos系统,大部分鼠标操作,如果参加下一期相同内容培训,学费可以减免一半。
Q:培训费包括哪些
A:包括学习费与一块1T全新的移动硬盘(主要是存放160GB的资料,我们需要预先拷贝进去),两顿午餐。
Q:没报上名怎么办?
A:请关注公众号,等待下一期招生通知。
Q:学习后,如果想开展分析业务没有服务器怎么?
A:提供包括装配分析工作站、软件安装与调试及培训服务,具有高性价比与实用性。
Q:我们科室同事想全部参加有优惠吗?
A:对于这类同一科室或同一公司多人需要培训的情况,请单独联系。
Q:可以为我们科室/公司单独提供上门培训吗?
A:可以的,具体事宜请联系下方的吴经理。
报名联系人:吴境雄 手机:13761757010,微信号:haf76433
文章来源:基因谷
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