文件名称：Molecular methods for bacterial strain typing；Approved guideline—First edition[菌株分型的分子生物学方法；批准指南(第一版)]

发布日期：2007年4月16日

版本号：A

适用范围：菌株分型目前存在于很多领域，包括医院临床微生物实验室；联邦、州和当地参考实验室；工业和商业实验室。同样，菌株分型的结果也用于许多不同场所，包括临床护理、公共卫生检查，特别是新兴传染病、食品药品行业，以及环境分析。

本指南的目的是提供一个框架，从而有利于菌株分型结果报告的一致性，协助实验室进行相关研究和专业人士对结果的应用。也将提供一个分析菌株分型数据的通用方法，以及解释由常用方法得到的分型结果的具体标准。该指南将重点关注分析细菌染色体DNA的技术，尤其是脉冲场凝胶电泳(PFGE) 和核苷酸测序技术；表型技术 (例如血清分型、噬菌体分型)，但是不会涉及以质粒为基础的技术。

主要内容：在对流行病暴发、实验室污染、 复发性感染的研究中所获得的病原菌进行分析时，分子生物学分型方法已经成为一个重要的工具。许多菌株分型方法是以DNA技术为基础的。然而，发展新方法得到更多的数据比定义可靠地用于解释结果的方法要容易得多。

临床和实验室标准协会编写了MM11-A号文件《菌株分型的分子生物学方法；批准指南》探讨了菌株分型方法的生物学背景及描述验证分型系统的过程。现在普遍应用的分型方法是脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型，详细讨论了来自这些方法的菌型数据分析时的问题。这则指南提供了各临床实验室通用的方法，用于解释、报告分子分型结果。对于选定的病原菌，分子分型系统 的应用和得到的结论会被详细考虑。